Trả lời văn thư số 0113/CV-ABAN ngày 09/05/2013 của Công ty và hồ sơ bổ sung ngày 28/05/2013 về kê khai khấu trừ thuế giá trị gia tăng (GTGT), Cục Thuế TP có ý kiến như sau:

- Căn cứ Điểm b, Khoản 7, Điều 14 Thông tư số 06/2012/TT-BTC ngày 11/01/2012 của Bộ Tài Chính hướng dẫn về thuế GTGT:

“Trường hợp cơ sở kinh doanh kê khai sót về số thuế GTGT đã nộp ở khâu nhập khẩu (kể cả số thuế GTGT đã nộp ở khâu nhập khẩu có chứng từ nộp thuế trước ngày 01/3/2012), số thuế GTGT đầu vào đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động thì được kê khai, khấu trừ bổ sung theo quy định của pháp luật về quản lý thuế.”

- Căn cứ Công văn số 3046/TCT-KK ngày 27/07/2009 của Tổng cục thuế về khấu trừ, hoàn thuế GTGT hàng nhập khẩu bị truy thu :

“.. Trường hợp doanh nghiệp nhập khẩu hàng hoá có hành vi khai gian, khai sai bị cơ quan Hải quan kiểm tra phát hiện truy thu thuế nhập khẩu, thuế GTGT hàng nhập khẩu theo quyết định xử phạt thì số thuế GTGT truy thu doanh nghiệp không được kê khai khấu trừ thuế GTGT đầu vào và không được tính vào chi phí hợp lý khi xác định thu nhập chịu thuế của kỳ phát sinh khoản truy thu đó”

Trường hợp Công ty theo trình bày có phát sinh số thuế GTGT phải nộp của nguyên liệu nhập khẩu để gia công theo quyết định ấn định thuế của cơ quan Hải quan “do trên tờ khai Hải quan đã quá hạn 275 ngày kể từ ngày nhập khẩu và số nguyên liệu thừa khi nhập khẩu về gia công khi cơ quan Hải quan kiểm tra phát hiện sau thông quan” nếu cơ quan Hải quan ban hành Quyết định xử phạt vi phạm hành chính đối với hành vi này thì Công ty không được kê khai khấu trừ số thuế GTGT đầu vào của hàng hoá nhập khẩu nêu trên.

Cục Thuế TP thông báo Công ty biết để thực hiện theo đúng quy định tại các văn bản quy phạm pháp luật đã được trích dẫn tại văn bản này.