Tổng cục Thuế nhận được công văn số 1206/HT-DYPO ngày 12/6/2018 của Văn phòng điều hành Công ty TNHH xây dựng Dongyang Hàn Quốc tại tỉnh Trà Vinh (sau đây gọi là VPĐH) vướng mắc về việc hoàn thuế GTGT đối với dự án ODA vay ưu đãi được NSNN cấp phát toàn bộ và NSNN không cấp vốn đối ứng để trả thuế GTGT. Về vấn đề này, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

1. Về Áp dụng văn bản quy phạm pháp luật:

Thực hiện theo hướng dẫn tại điểm 1 công văn số 3762/TCT-CS ngày 04/9/2014 của Tổng cục Thuế.

2. Về Chính sách thuế:

Tại khoản 5 Mục I Thông tư số 41/2002/TT-BTC ngày 03/05/2002 của Bộ Tài chính quy định:

““Nhà thầu chính” là tổ chức, cá nhân nước ngoài hoặc Việt Nam trực tiếp ký hợp đồng với chủ dự án ODA để xây lắp công trình hoặc cung cấp hàng hóa, dịch vụ cho dự án ODA”.

Tại khoản 2 Mục III Thông tư số 41/2002/TT-BTC và khoản 3, Mục III Thông tư số 123/2007/TT-BTC nêu trên quy định về các ưu đãi về thuế đối với Dự án ODA vay ưu đãi;

“Chủ dự án ODA vay ưu đãi được Ngân sách Nhà nước cấp phát toàn bộ, hoặc chủ dự án ODA được Ngân sách Nhà nước cấp phát một phần và một phần cho vay lại, được phê duyệt trước ngày 29/5/2001 (là ngày Nghị định số 17/2001/NĐ-CP có hiệu lực thi hành) được hoàn lại số thuế GTGT đã trả khi mua hàng hóa, dịch vụ chịu thuế GTGT để thực hiện dự án ODA như hướng dẫn tại điểm 3, Mục IV, Thông tư này.

Trường hợp chủ dự án ODA giao thầu cho các nhà thầu chính (không phân biệt nhà thầu chính là đối tượng nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ hay phương pháp trực tiếp) thực hiện xây lắp công trình, cung cấp hàng hóa, dịch vụ cho dự án ODA theo giá không có thuế GTGT thì nhà thầu chính không tính thuế GTGT đầu ra khi lập hóa đơn thanh toán với chủ dự án nhưng được hoàn lại số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ mua vào dùng để xây dựng công trình hoặc sản xuất hàng hóa, dịch vụ thuộc đối tượng chịu thuế GTGT, cung cấp theo hợp đồng ký với chủ dự án ODA như hướng dẫn tại điểm 3, Mục IV, Thông tư này”.

Căn cứ quy định trên, trường hợp Dự án ODA vay ưu đãi được Ngân sách Nhà nước cấp phát toàn bộ và không bố trí vốn đối ứng để trả thuế GTGT; Nhà thầu chính ký hợp đồng thầu với chủ Dự án ODA với giá không bao gồm thuế GTGT thì Nhà thầu chính không tính thuế GTGT đầu ra khi lập hóa đơn thanh toán với chủ dự án nhưng được hoàn lại số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ mua vào dùng để xây dựng công trình hoặc sản xuất hàng hóa, dịch vụ thuộc đối tượng chịu thuế GTGT, cung cấp theo hợp đồng ký với chủ dự án ODA.

Trường hợp tại Điều ước quốc tế (kể cả Điều ước quốc tế về ODA) mà Chính phủ Việt Nam ký kết hoặc tham gia có quy định về thuế liên quan đến việc thực hiện một dự án ODA cụ thể khác với hướng dẫn nêu trên thì việc áp dụng chính sách thuế đối với dự án ODA đó thực hiện theo các Điều ước quốc tế đã ký kết.

Tổng cục Thuế trả lời để VPĐH biết và đề nghị liên hệ với cơ quan thuế địa phương để được hướng dẫn cụ thể.