1. Cơ cấu tổ chức của Viện kiểm sát nhân dân thành phố Phúc Yên thuộc tỉnh Vĩnh Phúc do Viện trưởng Viện kiểm sát nhân dân tối cao quyết định theo quy định của pháp luật.

2. Biên chế, số lượng Kiểm sát viên, công chức khác và người lao động của Viện kiểm sát nhân dân thành phố Phúc Yên thuộc tỉnh Vĩnh Phúc do Viện trưởng Viện kiểm sát nhân dân tối cao quyết định trên cơ sở tổng biên chế, số lượng Kiểm sát viên của Viện kiểm sát nhân dân đã được Ủy ban Thường vụ Quốc hội quyết định tại Nghị quyết số 522e/NQ-UBTVQH13 ngày 16 tháng 8 năm 2012 về tổng biên chế và số lượng Kiểm sát viên, Điều tra viên của Viện kiểm sát nhân dân, Viện kiểm sát quân sự các cấp.