1. Xây dựng trình Chính phủ xem xét và quyết định phương hướng nhiệm vụ và kế hoạch dài hạn về nghiên cứu khoa học xã hội và nhân văn của Trung tâm.

2. Tổ chức, chỉ đạo thực hiện chương trình, kế hoạch nghiên cứu và xây dựng tổ chức của Trung tâm.

3. Tham gia đào tạo, bồi dưỡng cán bộ khoa học xã hội và nhân văn có trình độ đại học và trên đại học.

4. Tham gia việc hoạch định chính sách phát triển khoa học xã hội và nhân văn của cả nước.

5. Xây dựng và thực hiện kế hoạch hợp tác khoa học với nước ngoài theo các quy định hiện hành của Nhà nước.

6. Quản lý tổ chức, biên chế, tài sản và kinh phí của Trung tâm theo các quy định hiện hành của Nhà nước.

1. Viện Triết học

2. Viện Xã hội học

3. Viện Nghiên cứu Nhà nước và pháp luật

4. Viện Kinh tế học

5. Viện Kinh tế thế giới

6. Viện Sử học

7. Viện Khảo cổ học

8. Viện Dân tộc học

9. Viện Văn học

10. Viện Nghiên cứu văn hoá dân gian

11. Viện Ngôn ngữ học

12. Viện Nghiên cứu hán nôm

13. Viện nghiên cứu Đông Nam á

14. Viện Nghiên cứu Tôn giáo

15. Viện Tâm lý học

16. Viện Khoa học xã hội tại Thành phố Hồ Chí Minh.

B. CÁC CƠ QUAN PHỤC VỤ NGHIÊN CỨU KHOA HỌC:

1. Nhà xuất bản Khoa học Xã hội

2. Viện Thông tin khoa học xã hội

3. Tạp chí Việt Nam khoa học xã hội (bằng tiếng Anh)

C. CÁC CƠ QUAN GIÚP VIỆC GIÁM ĐỐC TRUNG TÂM

1. Văn phòng

2. Ban Tổ chức cán bộ và đào tạo

3. Ban Kế hoạch - Tài chính

4. Ban Hợp tác quốc tế

5. Thanh tra.