Trả lời công văn số 1162 CT/QD ngày 3 tháng 12 năm 2003 của Cục thuế tỉnh Sơn La về việc hoàn thuế GTGT đối với ban quản lý dự án thuỷ điện Nậm Chiến, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

- Điểm 3, Mục I, phần D Thông tư số 120/2003/TT-BTC ngày 12 tháng 12 năm 2003 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Nghị định số 158/2003/NĐ-CP ngày 10 tháng 12 năm 2003 của Chính phủ quy định chi Tiết thi hành Luật thuế giá trị gia tăng và Luật sửa đổi, bổ sung một số Điều của Luật thuế giá trị gia tăng quy định: “3 - Đối với cơ sở kinh doanh thuộc đối tượng nộp thuế theo phương pháp khấu trừ thuế có dự án đầu tư của cơ sở sản xuất đang trong giai đoạn đầu tư, chưa đi vào hoạt động, chưa đăng ký kinh doanh, đăng ký nộp thuế, có số thuế GTGT của hàng hoá, dịch vụ sử dụng cho dự án đầu tư từ 200 triệu đồng trở lên được xét hoàn thuế theo quý. Cơ sở kinh doanh phải kê khai, lập hồ sơ hoàn thuế riêng cho dự án đầu tư”.

Căn cứ hướng dẫn trên, trường hợp Tổng Công ty Sông Đà thuộc đối tượng nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ, có dự án đầu tư nhà máy thuỷ điện Nậm Chiến trên địa bàn tỉnh Sơn La đang trong giai đoạn đầu từ XDCB, chưa đi vào hoạt động, chưa đăng ký kinh doanh, đăng ký nộp thuế thì Tổng Công ty Sông Đà được xét hoàn thuế theo quý tại Hà Nội nếu số thuế GTGT của hàng hoá, dịch vụ sử dụng cho dự án đầu tư từ 200 triệu đồng trở lên. Tổng Công ty có trách nhiệm kê khai, lập hồ sơ hoàn thuế riêng cho dự án đầu tư. Thủ tục hồ sơ hoàn thuế thực hiện theo hướng dẫn tại Điểm I, Mục II, phần D Thông tư số 120/2003/TT-BTC nêu trên.

Khi dự án nhà máy thuỷ điện Nậm Chiến đi vào hoạt động, số thuế GTGT của hàng hoá, dịch vụ sử dụng cho dự án đã được hoàn thuế tại Hà Nội, nhà máy không được kê khai khấu trừ hoặc hoàn thuế tại tỉnh Sơn La.

Tổng cục Thuế trả lời để cục Thuế tỉnh Sơn la, Tổng Công ty Sông Đà được biết và thực hiện.