Trả lời văn bản số 01-2012/SK(BVMT) ngày 24/8/2012 của Công ty về thuế bảo vệ môi trường; Cục thuế TP có ý kiến như sau:

- Căn cứ Thông tư số 152/2011/TT-BTC ngày 11/11/2011 của Bộ Tài chính hướng dẫn về thuế bảo vệ môi trường;

- Căn cứ điểm 1 Công văn số 9048/BTC-CS ngày 06/07/2012 của Bộ Tài chính về thuế Bảo vệ môi trường:

“....Hàng hoá thuộc đối tượng chịu thuế BVMT được sản xuất trong nước hoặc trong khu phi thuế quan và bán ra giữa trong nước và khu phi thuế quan, trong khu phi thuế quan, giữa các khu phi thuế quan với nhau và xuất nhập khẩu tại chỗ (trong lãnh thổ Việt Nam) thì doanh nghiệp sản xuất hàng hoá phải khai, nộp thuế BVMT khi bán hàng hoá.

Khu phi thuế quan bao gồm: khu chế xuất, doanh nghiệp chế xuất, kho bảo thuế, khu bảo thuế, kho ngoại quan, khu kinh tế thương mại đặc biệt, khu thương mại - công nghiệp và các khu vực kinh tế khác được thành lập theo Quyết định của Thủ tướng Chính phủ, có quan hệ mua bán trao đổi hàng hoá giữa khu này với bên ngoài là quan hệ xuất khẩu, nhập khẩu.

Trường hợp doanh nghiệp đã nộp thuế BVMT đối với hàng hoá bán ra hoặc nhập khẩu từ nước ngoài vào Việt Nam thì hàng hoá đó sẽ không phải chịu thuế BVMT ở khâu mua bán sau đó (mua bán giữa tổ chức, cá nhân trong nội địa, trong khu khi thuế quan, từ nội địa vào khu phi thuế quan và ngược lại, giữa các khu phi thuế quan với nhau).

Ví dụ 1: Doanh nghiệp A (trong nội địa) sản xuất túi ni lông bán cho doanh nghiệp B (trong khu phi thuế quan). Doanh nghiệp A phải khai, nộp thuế BVMT đối với túi ni lông khi xuất bán cho doanh nghiệp B. Doanh nghiệp B không phải khai, nộp thuế BVMT đối với túi ni lông mua của doanh nghiệp A khi nhập vào khu phi thuế quan hoặc khi xuất bán lượng túi ni lông đó.”

Căn cứ quy định nêu trên, trường hợp Công ty (Doanh nghiệp hoạt động trong khu phi thuế quan) ký hợp đồng mua sản phẩm túi ni lông thuộc đối tượng chịu thuế bảo vệ môi trường từ Công ty TNHH SX TM Nhất Lợi (Doanh nghiệp hoạt động trong nội địa), nếu Công ty TNHH SX TM Nhất Lợi đã kê khai nộp thuế bảo vệ môi trường theo quy định thì Công ty không phải nộp thuế bảo vệ môi trường khi làm thủ tục hải quan. Trường hợp nếu Công ty đã kê khai, nộp thuế bảo vệ môi trường cùng với hồ sơ hải quan thì đề nghị Công ty liên hệ cơ quan hải quan để được hướng dẫn hoàn lại thuế bảo vệ môi trường đã nộp.

Cục thuế TP thông báo cho Công ty biết để thực hiện theo đúng quy định tại các văn bản quy phạm pháp luật đã được trích dẫn tại văn bản này.