Kính gửi: Cục Hải quan tỉnh Thừa Thiên Huế.

Trả lời công văn số 1390/HQTH-NV ngày 15/11/2022 của Cục Hải quan Thừa Thiên Huế phản ánh vướng mắc trong việc áp dụng chính sách thuế đối với doanh nghiệp chế xuất theo quy định tại Nghị định số 18/2021/NĐ-CP ngày 11/3/2021 của Chính Phủ. Tổng cục Hải quan có ý kiến như sau:

1. Về thời điểm hưởng ưu đãi thuế là khu phi thuế quan

Căn cứ khoản 3 Điều 28a Nghị định số 134/2016/NĐ-CP ngày 1/9/2016 được bổ sung tại khoản 10 Điều 1 Nghị định số 18/2021/NĐ-CP ngày 11/3/2021 của Chính phủ quy định: “3 Nhà đầu tư thực hiện dự án đầu tư (bao gồm cả dự án đầu tư mới và dự án đầu tư mở rộng) được áp dụng chính sách thuế đối với khu phi thuế quan theo quy định của Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu kể từ thời điểm là doanh nghiệp chế xuất nêu tại Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư. Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư điều chỉnh hoặc văn bản của cơ quan đăng ký đầu tư có thẩm quyền trong trường hợp không phải thực hiện cấp Giấy chứng nhận đăng ký đầu tư.

Việc kiểm tra thực tế điều kiện kiểm tra, giám sát hải quan để áp dụng chính sách thuế đối với khu phi thuế quan thực hiện theo quy định tại khoản 4, khoản 5, khoản 6 Điều này ”.

Căn cứ quy định nêu trên, trường hợp Công ty TNHH Công nghệ Bảo hộ Kanglongda Việt Nam là doanh nghiệp chế xuất (chỉ áp dụng đối với dự án Nhà máy Kanglongda Huế tại KCN Phong Điền) kể từ ngày 25/4/2021 thì được áp dụng chính sách thuế đối với khu phi thuế quan theo quy định của Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu kể từ thời điểm ngày 25/4/2021 (là ngày có hiệu lực của Nghị định số 18/2021/NĐ-CP).

2. Về việc thu hồi tiền hoàn thuế

Căn cứ quy định tại điểm c khoản 1 Điều 59 Luật quản lý thuế số 38/2019/QH14 quy định: “Người nộp thuế khai bổ sung hồ sơ khai thuế làm giảm số tiền thuế đã được hoàn trả hoặc cơ quan quản lý thuế, cơ quan nhà nước có thẩm quyền kiểm tra, thanh tra phát hiện số tiền thuế được hoàn nhỏ hơn số tiền thuế đã hoàn thì phải nộp tiền chậm nộp đối với số tiền thuế đã hoàn trả phải thu hồi kể từ ngày nhận được tiền hoàn trả từ ngân sách nhà nước”.

Căn cứ quy định tại khoản 1 Điều 108 Luật quản lý thuế số 38/2019/QH14 quy định: “Căn cứ vào kết quả kiểm tra, thanh tra thuế, thủ trưởng cơ quan quản lý thuế ra quyết định xử lý về thuế, thu hồi số tiền thuế đã hoàn không đúng quy định của pháp luật về thuế, xử phạt vi phạm hành chính và quản lý thuế theo thẩm quyền hoặc đề nghị người có thẩm quyền ra quyết định xử phạt vi phạm hành chính về quản lý thuế. Trường hợp xác định rõ hành vi vi phạm hành chính tại biên bản thanh tra thuế, kiểm tra thuế thì biên bản thanh tra thuế, kiểm tra thuế xác định là biên bản vi phạm hành chính”.

Căn cứ quy định nêu trên, trường hợp công ty TNHH Công nghệ Bảo hộ Kanglongda Việt Nam là doanh nghiệp chế xuất (chỉ áp dụng đối với dự án Nhà máy Kanglongda Huế tại KCN Phong Điền) kể từ ngày 25/4/2021 thì được áp dụng chính sách thuế đối với khu phi thuế quan theo quy định của Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu kể từ thời điểm ngày 25/4/2021. Do đó, Cục Hải quan tỉnh Thừa Thiên Huế thực hiện hoàn số tiền thuế nhập khẩu đã nộp của 10 tờ khai nhập khẩu loại hình A12 đăng ký từ ngày 14/9/2020 đến ngày 24/4/2021 (trước thời điểm Nghị định 18/2021/NĐ-CP có hiệu lực) là chưa đúng quy định. Yêu cầu Cục Hải quan tỉnh Thừa Thiên Huế thực hiện thu hồi số tiền thuế đã hoàn không đúng quy định nêu trên và báo cáo kết quả về Tổng cục Hải quan trước ngày 31/1/2023.

Tổng cục Hải quan thông báo để Cục Hải quan tỉnh Thừa Thiên Huế được biết và thực hiện./.