Ngày 02/01/2007, Tổng cục Hải quan nhận được phiếu chuyển hồ sơ của Tổng cục thuế đề nghị trả lời công văn số 54/CV-DVN ngày 21/11/2006 của Công ty Daiwa Việt Nam về thủ tục hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) nộp nhầm, Tổng cục Hải quan có ý kiến như sau:

Ngày 29/04/2005, Bộ Tài chính đã có công văn số 5249TC/TCST hướng dẫn thực hiện khấu trừ, hoàn thuế GTGT đã nộp thừa, nộp nhầm ở khâu nhập khẩu.

Theo đó, tổ chức, cá nhân nhập khẩu hàng hóa đã nộp thuế GTGT ở khâu nhập khẩu nhưng theo luật định không phải nộp (gọi là nộp nhầm) là đối tượng được khấu trừ, hoàn thuế GTGT. Trường hợp người nhập khẩu là đối tượng đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ thì số thuế GTGT đã nộp nhầm ở khâu nhập khẩu được tính vào số thuế GTGT đầu vào và được khấu trừ khi tính thuế GTGT ở khâu kinh doanh nội địa. Trường hợp Công ty không phải là đối tượng đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ thì số thuế GTGT đã nộp nhầm được hoàn lại.

Trình tự, thủ tục khấu trừ, hoàn thuế được hướng dẫn cụ thể tại điểm 2 công văn số 5249TC/TCST nêu trên.

Trường hợp Công ty Daiwa Việt Nam đã được Cục Hải quan Đà Nẵng xác nhận tiền thuế GTGT nộp thừa và hướng dẫn đến cơ quan thuế nội địa (cục thuế địa phương) để làm thủ tục hoàn lại khoản thuế đã nộp là đúng quy định.

Tổng cục Hải quan thông báo để Công ty Daiwa Việt Nam được biết và liên hệ trực tiếp với cơ quan thuế nơi công ty đóng trụ sở chính để được xem xét giải quyết cụ thể.