Căn cứ Thông tư liên tịch số 176/1998/TTLT-BTC-BCN-TCHQ ngày 25/12/1998, được bổ sung, sửa đổi tại Thông tư liên tịch số 120/2000/TTLT-BTC-BCN-TCHQ ngày 25/12/2000 của liên Bộ Tài chính - Công nghiệp - Tổng cục Hải quan; Quyết định số 1944/1998/QĐ-BTC ngày 25 tháng 12 năm 1998 của Bộ trưởng Bộ Tài chính về việc ban hành quy định thuế suất thuế nhập khẩu ưu đãi theo tỷ lệ nội địa hoá đối với các sản phẩm, phụ tùng thuộc ngành cơ khí - điện - điện tử.
Căn cứ ý kiến chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ tại điểm 1, Công văn số 294/CP-KTTH ngày 17/4/2001 của Chính phủ về việc xử lý kết quả kiểm tra tình hình sản xuất, lắp ráp xe hai bánh gắn máy.
Bộ Tài chính hướng dẫn việc xử lý thu thuế theo tỷ lệ nội địa hoá đối với bộ linh kiện nhập khẩu để sản xuất, lắp ráp xe hai bánh gắn máy năm 2001 của các doanh nghiệp đầu tư trong nước sản xuất, lắp ráp xe hai bánh gắn máy như sau:
1- Đối với các trường hợp trong năm 2000 đã thực hiện nộp thuế theo tỷ lệ nội địa hoá (có tờ khai hàng hoá xuất, nhập khẩu được tính thuế theo tỷ lệ nội địa hoá nộp cho cơ quan Hải quan trước ngày 01/01/2001, để áp dụng cho từng nhãn hiệu xe cụ thể) vẫn tiếp tục thực hiện nộp thuế theo tỷ lệ nội địa hoá với mức tỷ lệ nội địa hoá đã đăng ký thực hiện trong năm 2000 được Bộ Công nghiệp xác nhận. Các doanh nghiệp đã thực hiện chính sách thuế theo tỷ lệ nội địa hoá trong năm 2000 phải thực hiện quyết toán hàng nhập khẩu theo quy định tại điểm 7.2.2 Thông tư liên tịch số 176/1998/TTLT-BTC-BCN-TCHQ ngày 25/12/1998 của liên Bộ Tài chính - Công nghiệp - Tổng cục Hải quan. Nếu doanh nghiệp không thực hiện quyết toán theo đúng quy định thì không được áp dụng thuế suất theo tỷ lệ nội địa hoá.

2- Đối với trường hợp trong năm 2000 chưa thực hiện nộp thuế theo tỷ lệ nội địa hoá, sang năm 2001 doanh nghiệp thực hiện sản xuất, lắp ráp xe máy đăng ký thực hiện nộp thuế theo tỷ lệ nội địa hoá, thì tỷ lệ nội địa hoá làm căn cứ tính thuế năm 2001 là tỷ lệ nội địa hoá do các doanh nghiệp đăng ký thực hiện trong năm 2000 đã được Bộ Khoa học, Công nghệ và Môi trường ghi nhận cho từng nhãn hiệu xe cụ thể. Mức thuế suất thuế nhập khẩu thực hiện theo quy định tại Quyết định số 1944/1998/QĐ-BTC ngày 25/12/1998 của Bộ trưởng Bộ Tài chính.

3- Đối với trường hợp doanh nghiệp đăng ký sản xuất, lắp ráp loại xe hai bánh gắn máy có nhãn hiệu mới trong năm 2001 (nếu được phép của Chính phủ) thì tỷ lệ nội địa hoá làm căn cứ xác định tính thuế năm 2001 là tỷ lệ nội địa hoá của năm 2000 (theo Phụ lục 1 kèm theo Công văn số 06/BC-BNCL ngày 19/03/2001 của Bộ Công nghiệp). Thuế suất thuế nhập khẩu thực hiện theo Quyết định số 1944/1998/QĐ/BTC ngày 25/12/1998 của Bộ trưởng Bộ Tài chính.

4- Hướng dẫn này thực hiện cho các lô hàng nhập khẩu có tờ khai hàng hoá xuất, nhập khẩu nộp cho cơ quan Hải quan từ ngày 01/5/2001 và được áp dụng cho từng nhãn hiệu (tên) xe cụ thể.

Đối với các lô hàng nhập khẩu có tờ khai hàng hoá xuất, nhập khẩu nộp cho cơ quan Hải quan từ ngày 01/01/2001 đến hết ngày 30/4/2001, cơ quan Hải quan nơi làm thủ tục nhập khẩu tính lại thuế theo hướng dẫn của văn bản này và thông báo cho doanh nghiệp biết số thuế nhập khẩu phải nộp bổ sung nhưng chưa thực hiện truy thu.

Cuối năm 2001, trên cơ sở báo cáo quyết toán của doanh nghiệp được cơ quan Kiểm toán xác nhận về thuế đã nộp và tỷ lệ nội địa hoá đạt được trong năm 2001, cơ quan thuế phối hợp với cơ quan Hải quan xem xét thực hiện việc hoàn thuế hoặc truy thu thuế theo quy định tại Thông tư liên tịch số 120/2000/TTLT-BTC-BCN-TCHQ và chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ tại Công văn số 294/CP-KTTH ngày 17/04/2001 của Chính phủ.

Bộ Tài chính hướng dẫn việc thu thuế nhập khẩu theo tỷ lệ nội địa hoá đối với việc sản xuất, lắp ráp xe hai bánh gắn máy theo chỉ đạo của Chính phủ để Tổng cục Hải quan và các doanh nghiệp đầu tư sản xuất, lắp ráp xe hai bánh gắn máy trong nước thực hiện. Trong quá trình thực hiện nếu có vướng mắc đề nghị Tổng cục Hải quan và các doanh nghiệp phản ánh về Bộ Tài chính và các Bộ ngành có liên quan nghiên cứu, xử lý kịp thời.